《加工贸易合同联网审批系统》是中国国际电子商务中心受商务部委托开发、应用于我国加工贸易领域的电子政务信息网络系统，是我国外经贸信息化建设工程的重要组成部分之一。该系统利用计算机网络技术实现了对加工贸易合同及相关领域的标准化、规范化、科学化、网络化管理，构建起全国统一的加工贸易企业及政府应用网络支撑体系。
现行加工贸易电子联网审批管理系统分为企业端和审批端系统，前者供加工贸易企业进行合同申请，后者供各级加工贸易审批管理机关审批使用。两个端的系统均分为C/S和B/S两种形式。
系统企业端包括合同的申请、变更、内销、核销以及作废，不作价合同的申请和变更等功能模块，涵盖了加工贸易业务流程中的主要环节。合同申请的主要内容包括进口料件、出口成品、进口料件单耗、国产料件、国产料件单耗、国外厂商和加工企业等信息。企业可以根据合同的实际情况按要求进行填写，并进行合法性检查，通过检查功能，可以大大减小企业合同错误填写的几率，从而提高合同申报乃至审批的效率。企业还可以在软件中将合同进行上报，并等待审批结果，并最终获得批准证号码直至打印出合同批准证。当前正在使用的客户端包括JM2000、JM WEB和JM2003系统，其中JM2003系统是在2003年全新设计和编码的软件，采用了一些最新的技术，并与实际业务结合紧密。
系统审批端包括对企业合同、内销合同以及不作价设备申请的查看，审批的功能。可以为企业打印合同批准证。当前正在使用的系统包括JM2003电子联网审批系统和JM WEB联网审批系统。二者近期都按照最新的业务流程进行了改造，可以满足最新的业务需求。
系统运用 CA 证书、电子钥匙等技术，充分保证了数据的安全性和用户身份的合法性。该系统的开通不但为企业与各级业务主管机关架起业务沟通的桥梁，更为我国加工贸易数据及时汇总、加强政府宏观调控提供了有力的工具。
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